Alpha Mission II est un tireur à défilement vertical 2D avec beaucoup de profondeur pour deux joueurs se déplaçant verticalement vers le haut des planches d'écran tirant tout ce qui bouge. Équipez jusqu'à trois armures, qui servent également d'armes, pour diverses attaques telles que le laser et le lance-flammes. Utilisez-les pour vaincre le mal et sauver l'humanité !