Beyond Good & Evil est un jeu d'aventure d'action avec des éléments de résolution de puzzle et de jeux furtifs. Le joueur contrôle le protagoniste, Jade, du point de vue de la troisième personne. Jade peut courir, bouger furtivement, sauter sur les obstacles et les fosses, monter des échelles, pousser ou bash des portes et des objets, et s'aplatir contre les murs. En tant que Jade, le joueur enquête sur un certain nombre d'installations à la recherche de la vérité sur une guerre avec une menace extraterrestre.