En raison de son envie des réalisations de Frogger et de l'attention qu'il reçoit, Swampy le Crocodile éclos un projet dérisoire pour envahir son étang et enlever les frères et sœurs de Lillie Frog. Quelle vile crocodile ! En assumant le rôle de la grenouille vendeuse, vous devez contrecarrer le crocodile maléfique et sauver les têtards innocents du mal.
Divisée en différents mondes interactifs en 3D, la mission de Frogger s'étend sur plus de 30 niveaux encombrés d'obstacles à la vie et de monstrueux copains qui bloquent le chemin de la victoire. Heureusement, la grenouille a été dotée de pouvoirs suprêmes, y compris des houblons et des super-houblons réguliers, la capacité de flotter au-dessus de l'eau et de la terre, une croque de pouvoir pour avoir appelé des têtards manquants et une langue à la recherche d'insectes.