Alors que le stade 2 de Pokémon a une histoire, des progrès dans le jeu peuvent être réalisés en remportant des Coupes dans le stade et en complétant le château Gym Leader. Lorsque toutes les Coupes auront été remportées et que le Gym Leader Castle sera terminé, le Rival du joueur apparaîtra. La défaite du Rival déverrouillera la deuxième ronde, au cours de laquelle le joueur doit remettre en question le stade, le château de Gym Leader et le Rival afin de terminer le match. Mais ils ont différents Pokémon et la difficulté est beaucoup plus élevée.

Stade:

Le joueur commence par choisir 6 Pokémon différents. Il y a 250 Pokémon différents à choisir, y compris un Pokémon légendaire. Les tournois Pokémon ont lieu au Stade. Il y a quatre Coupes à participer. Chaque manche comprend huit batailles, et chaque Coupe, à l'exception de la Petite et Première Coupe, comprend quatre manches, nommées d'après les Poké Balls, qui doivent être dégagées pour gagner cette Coupe.