Super Mario 64 Disk Version est un prototype de disque qui a été créé pour l'affichage au Nintendos Shoshinkai show en 1996, pour aider à promouvoir le 64DD add-on, mais n'a jamais reçu une version générale. Le jeu lui-même n'est que légèrement différent de la version de cartouche qui avait été publiée au Japon quelques mois auparavant, avec un thème château modifié, l'omission de la célèbre tête de Mario 3D et quelques bugs révolutionnaires dans Tiny Huge Land.