Luffy et ses compagnons sont sur le point d'arriver à Enies Lobby et se préparent à livrer bataille pour récupérer Robin et Franky. Pendant ce temps-là, les agents du CP9 amènent Robin et Franky à Spandam, leur chef.

Luffy, qui n'a pas suivi le plan, débarque seul et en premier à Enies Lobby. Il se dirige vers le bout de la ville mais des centaines de soldats s'oppose à lui. Il sème le chaos dans toute la ville, laissant le champ libre à ses compagnons.

Il faut ouvrir la deuxième porte pour passer. Commence alors un combat entre les deux géants et la Franky Family. Luffy continue d'avancer seul dans la ville tout en massacrant la marine. Robin et Francky sont amenés devant Spandam. Et enfin le Rocketman et l'équipage du chapeau de paille se prépare à entrer sur l'île.

En utilisant la barrière d'Enies Lobby, le train survole la première et la deuxième porte pour atterrir au milieu d'une bataille entre la Francky Family et les soldats. Luffy fait face à des milliers de soldats avec une détermination et une force remarquable mais encerclé il arrive à une impasse.

Arrivé au centre de Enies Lobby, Nami, Zoro, Sanji, Chopper et Sniperking s'avancent pour retrouver Luffy et font face aux soldats du gouvernement. Nami montre son nouveau pourvoir à l'aide de son bâton. Luffy continue de semer la pagaille dans la ville pour retrouver son amie.

Spandam annonce que l’équipage de Luffy sera capturé et tué contrairement à l'accord. Spandam ne souhaite que le pouvoir et pour se venger il battra Robin et Franky. En se rapprochant de Luffy, Zoro, Nami, Sanji et Choper se rendent compte qu'ils ont perdu Sniperking. Luffy réussit à semer les soldats et se trouve devant le dernier bâtiment protégé par Blueno. Le combat va commencer.

Les deux géants qui gardaient une des grandes portes se sont ralliés à Sniperking, car ils font partie de l'équipage de Broggy (rencontré sur l'île de Little Garden). Ils vont donc aider Pauly à la porte principale. Zorro et ses compagnons continuent d'avancer vers le tribunal mais Sodom est mortellement blessé. Sur le toit du tribunal se trouvent Luffy et Blueno qui se battent. Luffy montre une force et une rapidité extraordinaire.

Les quatre membres de Luffy et la Franky Family approchent de la place du tribunal. Gomor assommé, l'équipage va vouloir se défendre malgré les centaines de soldats qui les entourent. Mais le monstre se relève aveugle, et parvint difficilement devant la tribunal. Pendant ce temps, les deux géants et Usopp prennent pars au combat au côté de Pauly. Kalifa et Kaku ont mangé les fruits du démons offert par Spandam ; ils attendent de découvrir leurs nouveaux pouvoirs. Enfin, Luffy mène un combat intense contre Blueno.

Avec l'aide de Zorro, Sanji et Gomorrhe, le reste de l'équipage arrive à la place du tribunal et se sépare pour trouver les leviers permettant d'ouvrir le pont afin d'aller chercher leurs compagnons. Spandam, face à Robin et Franky, prend conscience de la gravité de la situation grâce à l'escargot-phone. Luffy qui a un net avantage doit encore combattre à un niveau plus élevé s'il veut protéger ses amis. Il se prépare donc pour une puissante technique.

Les Chapeaux de Paille viennent d'entrer dans le tribunal, avec les autres membres de la famille Franky. Ces derniers choisissent de rester affronter le juge aux trois têtes Baskerville et de bloquer l'entrée du bâtiment pour empêcher les renforts de rentrer, avec Yokozuna. Au-dessus d'eux, Luffy affronte Blueno en Gear Second, tandis que son équipage cherche à le rejoindre. Sur la route principale, les géants ont vaincu la Meute de la Loi et, avec Usopp et les contremaîtres de Galley-La, se dirigent vers la place du tribunal. Luffy bat Blueno, passe devant son corps inconscient et crie à Robin qu'il est arrivé.

Franky ne comprend pas pourquoi Robin refuse d'être sauvé après que Spandam a rompu sa promesse. Alors que Luffy leur hurle dessus, Franky décide de faire face à Robin. Il utilise son cola restant pour gonfler ses fesses. Avec son pet, il parvient à s'échapper avec Robin tout brisant ses chaînes dans le processus et à être à portée de Luffy. Luffy veut les rejoindre pour sauver Robin, mais elle lui dit de rester car elle veut mourir. Devant le tribunal, Yokozuna succombe aux attaques des Jurés. Les marines sont sur le point de pénétrer dans l'enceinte mais les géants arrivent alors reprendre le contrôle de la situation. Kashi jette Usopp dans les airs, où il rejoint l'équipage des Chapeaux de Paille. De nouveau rassemblés, ils font face à Robin et au CP9, en attendant que le pont-levis soit abaissé.

Il y a 20 ans, Robin a grandi sur l'île d'Ohara. Sa tante, chez qui elle vit depuis le départ de sa mère partie faire des recherches, la traite mal, tout comme les autres enfants qui l'harcèlent à cause de ses pouvoirs. Étudiant dans la plus grande bibliothèque du monde, situé à l'intérieur de l'Arbre de la Cognition, Robin obtient le rang de chercheur en archéologie à l'âge de huit ans. Dans l'espoir d'aider les autres archéologues dans l'étude des Ponéglyphes, recherche interdite par le Gouvernement Mondial, elle apprend même à les déchiffrer. Cependant, sa demande est rejetée car elle est jugée trop jeune pour le faire. Déçue d'être de nouveau rejetée, elle marche le long du rivage, où elle tombe sur Haguar D. Sauro, un vice-amiral géant désertant la Marine. Les deux deviennent rapidement amis et Sauro lui apprend alors à rire.

Sauro est choqué d'apprendre que Robin est la fille de Nico Olvia et qu'il a échoué sur les rives d'Ohara. Sa mère, qui est revenue chez elle avec un navire de la marine volé, se précipite vers l'Arbre de la Cognition pour avertir ses collègues de l'arrivée d'une flotte de la marine. Cependant, elle arrive trop tard. Le navire gouvernemental qui transportait le père de Spandam, Spandine, et ses hommes est déjà arrivé. Ils forcent la population à monter à bord d'un navire d'évacuation, tandis que les soldats du gouvernement arrêtent les savants et fouillent la bibliothèque. Le professeur Clover, le mentor de Robin, exhorte Robin de monter à bord du navire d'évacuation, mais elle refuse. Comme il devient clair que les chercheurs ne seront pas pardonnés pour leurs recherches interdites, Clover demande à être autorisé à parler aux chefs du gouvernement mondial, connus sous le nom de Conseil des Cinq Doyens.

Le professeur Clover est autorisé à parler avec le Conseil des Cinq Doyens. Il décrit une civilisation qui existait il y a des centaines d'années et qui a disparu au moment où le gouvernement mondial a pris le pouvoir. Il laisse entendre que le gouvernement actuel a tenté d'effacer ses anciens ennemis de l'histoire. Considérant qu'Ohara en savait désormais trop, le Conseil des Cinq Doyens ordonne à Spandine de tuer le professeur, les archéologues et de détruire l'île. La bibliothèque s'enflamme et les archéologues tentent de sauver les livres stockés à l'intérieur. Lorsqu'elle croise sa mère, Robin lui révèle qu'elle est devenue une archéologue capable de déchiffrer les Ponéglyphes, marquant ainsi leur retrouvaille mais courte. Autour d'eux, les coups de canon dus au Buster Call se font entendre. Olvia confie alors sa fille à Sauro pour qu'ils s'enfuient de l'île, tandis qu'elle aide ses collègues à sauver le savoir contenu dans la bibliothèque.

Sauro combat les navires de la Marine, afin que Robin puisse s'échapper. Elle tente de monter à bord du navire d'évacuation, mais à cause des ordres de Spandine, l'accès lui est refusé. Le Vice-Amiral Kuzan, l'actuel Amiral Aokiji, entre en scène pour se battre contre Sauro. Pendant leur affrontement, le navire d'évacuation est coulé par le fanatique vice-amiral Sakazuki, l'actuel Amiral Akainu. Sauro, sur le point de mourir, ordonne à Robin de fuir sur son radeau. Contre toute attente, Kuzan aide Robin à s'échapper. Dès lors, Robin passe sa vie à fuir les gens, ne pouvant faire confiance à personne, dans un monde qui croit que sa seule existence est un péché. Dans le présent, Robin admet sa plus grande peur : être vue comme un fardeau par ses coéquipiers et car être avec elle, c'est avoir le monde pour ennemi. Sachant enfin ce qui l'a éloignée, Sniperking, sur l'ordre de Luffy, brûle le drapeau du gouvernement, déclarant ainsi la guerre au gouvernement mondial !

Alors que le pont-levis menant à Robin est sur le point de descendre, Luffy se remémore la rencontre avec Shanks et son équipage, 10 ans plus tôt, dans son village de Fuchsia à Eastblue. Comme Shanks l'avait protégé à l'époque, il veut protéger à son tour ses amis.

Sur le point d'affronter le CP9, Zoro et Usopp se souviennent respectivement pourquoi ils ont décidé de rejoindre Luffy dans sa grande aventure. Le bras droit du futur Seigneur des Pirates a été sauvé par Luffy alors qu'il allait se faire exécuter. Le canonnier de l'équipage du Chapeau de Paille a décidé de suivre Luffy après que ce dernier ait sauvé son village des pirates de Kuro.

Comme ses amis, Nami se rappelle la raison pour laquelle elle est devenue une pirate, malgré les détestait auparavant. Comme elle a été sauvée par ses amis contre les pirates d'Arlong, elle veut se battre à son tour et ainsi sauver son amie Robin.

Sanji et Chopper ne comprennent que trop bien les sentiments actuels de Robin, le cuisinier avec le sacrifice de Zeff et le médecin avec la solitude connue jusqu'à sa rencontre avec le Dr Hiluluk. Ainsi, ils souhaitent encore plus sauver leur amie d'une mort certaine.

Pendant qu'elle attend que ses amis viennent à son secours, Robin pense aux évènements survenus depuis Water Seven, de sa rencontre avec le CP9 et celle avec Spandam. Elle pense également à son histoire tragique à Ohara et du chemin parcouru jusqu'à son choix : vivre et continuer de naviguer avec les Chapeaux de Paille.

Franky avait caché les plans de l'arme antique Pluton dans son corps. Il les montre au CP9, expliquant qu'ils existaient uniquement pour être construits en opposition aux réveils éventuels des armes antiques . Ayant réalisé que Robin, n'était pas le démon décrit, il parie le destin du monde sur la capacité des Chapeaux de Paille à la sauver et brûle les plans. Enragé, Spandam jette Franky hors du balcon. Kokoro fait monter Rocketman sur le pont-levis à moitié abaissé. Les Chapeaux de Paille sautent à bord. Frappant Franky en chemin, le train saute par-dessus la cascade et s'écrase dans à l'intérieur de la Tour de la Justice.

Luffy et son équipage doivent récupérer les clés que possèdent les membres du CP9 pour libérer Robin.

Alors que Luffy décide de se rendre aux portes de la justice pour rattraper Robin et ses ravisseurs, Nami et Sanji ont leurs rencontres respectives avec Kumadori et Kalifa tandis que Franky rencontre Fukurou. Alors que Zoro engage Kaku dans un intense combat à l'épée, la tentative d'Usopp de voler une clé à l'agent CP9 endormi Jabra échoue lorsque l'assassin se réveille et se révèle avoir le pouvoir du Dog Dog Fruit Model: Wolf. Dans le même temps, Kaku révèle à Zoro son nouveau pouvoir de Fruit du Démon : le Modèle de Fruit Ox-Ox : Girafe. Mais après s'être fait tomber avec Zoro sur le sol où se trouvent Usopp et Jabra, Kaku se retrouve ridiculisé pour son apparence. Après qu'Usopp ait accidentellement placé la moitié d'une paire de menottes en pierre de mer sur Zoro, il finit par inciter Kaku à utiliser un Tempest Kick sous sa forme d'homme bête pour couper verticalement le bâtiment en deux. L'attaque se calme et Zoro se retrouve accidentellement menotté à Usopp.

Se retrouvant menottés après que l'homme-bête amélioré de Kaku, Tempest Kick, ait endommagé la Tour de la Loi, Zoro et Usopp apprennent que chacune des clés est numérotée. Mais comme ni Kaku ni Jabura n'ont la clé nécessaire pour libérer leur proie de leurs menottes en pierre de mer, les deux membres du CP9 sont contraints de reprendre le combat. Chopper arrive à ce moment-là et est envoyé pour obtenir la clé numéro 2 de l'un des autres assassins. Chopper rencontre Nami alors qu'elle tentait de fuir Kumadori après avoir volé la clé numéro 3, assommant l'agent du CP9. Peu de temps après, Nami et Chopper trouvent un Sanji rond et brillant frappant le sol de quelques étages.

Nami monte les escaliers pour affronter Kalifa. Seulement, Kumadori les a rattrapés et poursuit Nami. Chopper s'interpose en lui donnant au passage un bon coup de sabot.

Dans cet épisode, nous voyons la nouvelle technique de combat de Zoro et Sogeking, qui, ces derniers, n'ont d'autre choix que d'utiliser cette technique.

Kumadori parvient à sortir du frigo. A la surprise de Chopper, il en ressort gros, comme s'il en avait dévoré tout le contenu.

Avec la défaite de Buggy le Clown et sa bande, le village a retrouvé son calme. Luffy Oyabun profite toujours des plats du restaurant de Onami, qui a toujours si peu de clients.

Aujourd'hui est un jour spécial : un concours de Mochi a lieu. Mais pas n'importe lequel : du haut du palais, le roi lance de nombreux Mochis.

Chopper se transforme en un monstre terrifiant. Kumadori l'attaque, mais ses techniques se montrent totalement inefficaces sur le monstre.