Le voyage de Sacha pour devenir le meilleur Dresseur de la Ligue Indigo continue, mais son amitié avec son concurrent Richie de la Ligue Pokémon risque-t-elle de lui mettre des bâtons dans les roues ? À la fin de ses aventures à Kanto, Sacha découvre qu'il lui reste encore beaucoup à apprendre lorsque le Professeur Chen l'envoie dans les Îles Oranges avec ses amis. Pierre tombe fou amoureux de la belle Professeure Flora et décide de rester avec elle, laissant Sacha et Ondine poursuivre seuls leurs aventures (du moins, jusqu'à ce qu'ils rencontrent l'intrépide observateur Pokémon Jacky Léon !).
Sacha et ses amis veulent aider un homme à transporter tous les Electrode et les Voltorbe qui envahissent la ville dans un endroit où ils ne nuiront à personne, rendant ainsi la ville de nouveau habitable.
Le plus lamentable chapiteau du monde Sacha et ses amis sont de retour au Bourg-Palette. Ils y revoient Pierre, qui aide la mère de Sacha. Le nom du professeur Flora est devenu pour lui tabou.