En 2257, le commandant Sinclair et les officiels de Babylon 5 s'apprêtent à accueillir l'ambassadeur Kosh du puissant et mystérieux Empire Vorlon. Mais à peine celui-ci est-il arrivé sur la station, qu'il est victime une tentative d'assassinat: au Medlab, le docteur Kyle ne peut rien faire étant donné que Kosh est enfermé dans une sorte de carapace protectrice et que l'Empire Vorlon refuse catégoriquement qu'elle soit ouverte. Mais Sinclair passe outre les ordres des Vorlons afin de sauver Kosh: le docteur Kyle ouvre en partie sa combinaison et Lyta Alexander, la télépathe commerciale de la station, le scanne dans le but de découvrir ce qui s'est passé. Durant le scan, elle va découvrir que l'ambassadeur a été empoisonné par le commandant Sinclair! Les Vorlons demandent alors l'extradition du commandant vers leur monde, et Sinclair, bien que clamant son innocence, n'a pas d'autres choix que de s'y résoudre. Garibaldi décide alors de mener l'enquête dans le but de découvrir le véritable coupable...

10 ans avant la création de la station Babylon 5, une guerre dévastatrice éclate sur un simple malentendu entre les humains et le peuple Minbari. Ils s'affrontent dans une guerre sans merci qui ne pouvait se terminer que par l'extermination totale de l'humanité...

Une guerre est déclarée aux Ombres et un conflit éclate avec la Terre. Entretemps, l'équipe de la station spatiale risque le tout pour le tout pour sécuriser un passage mystérieux et obscur. Pour une évasion éventuelle vers une autre dimension... ou laisseront-ils plutôt s'échapper ce qui se trouve de l'autre côté ?

Lorsqu'un archéologue emporte une relique volée vers la station spatiale Babylon 5, il met tout le monde en danger. Les Soul Hunters, une race immortelle qui s'empare des esprits pour les enfermer à jamais, assiègent le poste isolé. Babylon 5 est pris entre deux feux : d'un côté les Soul Hunters et de l'autre, les esprits courroucés en fuite. Une issue semble introuvable.

Une nouvelle génération de combattants pour la liberté se met en marche pour protéger l'univers. Ils vont être confrontés à la menace ultime de l'homme : un fléau biogénétique mortel répandu sur la Terre par une race de méchants aliens. Les Rangers doivent faire vite pour trouver une solution, avant que l'humanité ne s'éteigne à jamais.

Les Rangers, un ordre de prêtres guerriers, errent depuis plus de mille ans dans l'obscurité des étoiles, où ils protègent des centaines d'univers contre l'invasion et la destruction. Jusqu'à ce qu'une nouvelle menace extraterrestre surgisse aux frontières de l'Alliance Interstellaire, une force plus vieille et plus puissante que toute autre chose...

Le colonel Lochley demande à un prêtre catholique de se rendre à Babylon 5 quelques jours avant l’arrivée du président Sheridan à l’occasion de la célébration du dixième anniversaire de l’Alliance interstellaire. Un membre de l’équipe qui venait de rentrer de vacances sur Terre s’était plaint d’avoir entendu des voix avant de se barricader dans une section de la station. Le membre d'équipage, Burke, est maintenant retenu dans une cellule de sécurité et prétend être possédé par un esprit démoniaque.

En route vers Babylon 5 pour la célébration de son anniversaire, Sheridan accorde à contrecœur une interview à ISN. Il mentionne son regret que Londo ne soit pas à la célébration pour représenter les Centauris, mais que son navire embarque le Prince Regent Vintari, troisième dans l'ordre de succession au trône. La nuit précédant le rendez-vous, Galen apparaît à Sheridan dans un rêve et lui montre une vision de la destruction de New York. Dans 30 ans, l’empereur Vintari tentera de restaurer l’ancienne gloire de la République en détruisant un vieil adversaire, la Terre. Tout cela peut être évité si Sheridan accepte de tuer Vintari maintenant.

Le créateur et producteur exécutif de la série, J. Michael Straczynski, a supervisé une édition spéciale de The Gathering, diffusée sur TNT immédiatement après le nouveau téléfilm, In the Beginning. Les scènes ont été montées pour se dérouler à un rythme plus rapide, en restaurant 14mn de séquences, ajoutant du développement des personnages. Parmi les ajouts notables, il y a une phrase prophétique prononcée par Kosh lorsqu’il rencontre Sinclair pour la première fois. Supprimé de la special edition est un voyage à travers le secteur extraterrestre de la station qui, selon certains téléspectateurs, ressemblait trop à un zoo. Les répliques de Tamlyn Tomita avaient à l’origine été complètement redoublées car le studio pensait qu’elle sonnait trop dure ; La nouvelle édition a restauré sa performance originale. La musique originale, composée par Stewart Copeland, est remplacée par une partition de Christopher Franke, qui a composé la musique de la série, jouée par le Berliner Symphoniker.