Derk le mercenaire a commis un meurtre. Hercule l'amenait à Spartes pour son procès quand un terrible orage a éventré son bateau. Sur une île deserte, Hercule poursuit Derek alors même qu'une bande de pirates les prend en chasse.

Dédale l'inventure est consumé par la culpabilité à cause de la mort de son fils, Icare, qui a volé trop près du soleil. Quand Hercule retrouve son ami de toujours en Euboée, Dédale invente des armes de destruction massive pour le cruel roi Nikolos. Hercule sait que celui-ci profite du deuil de son ami. Nikolos tente de le tuer avec la dernière création de Dédale, mais Hercule se montre plus malin..

Hephaistos, le dieu du feu, aime secrètement Aphrodite. Son assistant dévoué, Iagos, imagine un plan pour offrir à son maître un substitut de la déesse de l'amour en échange d'un puissant bouclier de bronze. Iagos va chercher Leandra, une belle mortelle, qui a rejeté Hephaistos 50 ans plus tôt et l'a poussé à suspendre la vie de celle-ci dans le temps. Aphrodite, qui vient de décider d'arrêter de réunir des couples, va avec Iolaus au secours de Leandra.

Réveillé par des voleurs, la momie Ishtar se relève d'entre les morts. Hercule doit retrouver la momie avec sa descendante, la princesse Anuket. Mais le méchant Sokar rechercher aussi cette momie et récupère son puissant pendantif doré, la croix de vie de Salmoneus, et se prépare à s'emparer du trône d'Egypte avec Anuket à ses côtés.

Quand Iolaus apprend qu'une machine à tuer s'est enfuie, il attend à trouver l'Executeur. A la place, il rencontre l'Executeur II, une nouvelle version de l'assassin d'Hera. Elle blesse mortellement Iolaus, dont la dernière action est de mettre Hercule en garde.

Typhon, le gentil géant, et Echnide, la mère de tous les monstres, envoie à Hercule un faire-part de naissance. Mais le voleur Klepto kidnappe l'enfant, une créature en forme de poulpe appelée Obie. Klepto apporte le petit monstre au guerrier Bluth, à qui Hera a promis pouvoir et richesse s'il lui amène Obie.

Aphrodite est consumée par la jalousie à l'idée que Psychée, une mortelle, est aussi belle qu'elle. Mais son fil, Cupide, est amoureux de celle-ci. Quand Hercule reçoit accidentellement une flèche de l'arc de Cupide, il tombe amoureux de la jeune femme, et la jalousie de Cupide le transforme en montre vert.

La redoutable reine Parnassa de Kastus a perdu son fils Millius au combat, il y a des années. Elle s'allie avec Hera pour rendre Hercule amnésique. Elle élabore ensuite un plan pour que le fils de Zeus pense qu'il est vraiment Millius, le leader de l'armée sanguinaire.

Un rêve convainc Iolause de voyager vers le nord pour rejoindre d'autres personnes appelées de la même façon. Pendant ce temps, le roi Polonius et la reine Maliphone tente de réunir tous les petits garçons de la province pour s'assurer que son propre enfant héritera du trône.

Un dragon nommé Braxis s'est échappé, dans la province de Laurentia, détruit des villages et tue des guerriers qui ont combattu aux côtés de Iolaus et Hercule. Adamis et Cynée sont responsables des actes du dragons. Ils manipulent Braxis et le convainquent qu'Hercule et Iolaus ont tué sa mère.

Le roi Oreste, cousin et sosie d'Iolaus, espère établir une Ligue des Nations pour apporter la paix à tous les royaumes des alentours. Mais le roi Xenon de Garantus a d'autres projets. Son homme de main tue Oreste, et Iolaus se fait passer pour son cousin pour mettre sur pied le plan de paix.

Alcmène, Iphiclès, Jason, Falafel et Iolaus veulent organiser une fête d'anniversaire pour Hercule. Mais ils se font empoisonner par le traître Callisto, envoyé par Hera pour tuer Hercule. Pour les sauver, Hercule accepte de l'accompagner au labyrinthe des Dieux, où l'Arbre de la Vie offre un remède. A leur arrivée, Callisto piège momentanément Hercule et mange un fruit de l'arbre, ce qui le rend immortel.

Le prince Nestor veut les cornes et les sabots dorés de Séréna, la magnifique mi-femme mi-biche, connue sous le nom de Biche d'Or. Nestor veut aussi tuer Hercule avec une flèche trempée dans le sang de la Biche d'Or, un projet qu'approuve Ares.

Hercule demande à Séréna en mariage et celle-ci a le courage de requérir sa liberté auprès d'Ares. Mais le dieu de la guerre, très jaloux, est décidé à détruire cette relation. Pendant ce temps, Séréna et Hercule voyage dans l'au-delé pour recevoir la bénédiction de sa femme décédée.

Hercule trouve très difficile de s'adapter à la réalité sans sa force surhumaine. Pendant ce temps, Ares et son neveu, Discorde, complotent pour tuer Hercule, ce qui ne facilite rien. Un jour, celui-ci se réveille et trouve sa femme morte à côté de lui. Elle a été assassinée.

A la recherche de son cousin Regina, Iolaus et sa compagne, Moira, trouvent Salmoneus à la place. Il a découvert une cité souterraine qui semble être Utopie. Mais le chef de la cité, Kamaros, fait un lavage de cerveau à ses sujets. Salmoneus et Regina tombent sous le sort de Kamaros, de même que la belle Aurore et sa petite soeur de 10 ans Lorel, que Kamaros vénère comme une déesse.

En 1789, à Troyes, en France. Le comte François Demarigny qui ressemble à s'y méprendre à Salmoneus, partage son carrosse avec Lady Marie De Valle, une belle aristocrate. Il tire de son manteau une rose jaune à longue tige, emblème de l'infâme révolutionnaire, surnommé le Renard de la Chartreuse

Salmoneus a décidé de mettre la main sur le marché des engrais des Ecuries d'Augias. Hercule accepte de le présenter à Palamedes, le palefrenier du roi Augias. En arrivant dans le royaume d'Augias, ils se rendent dans un temple d'Aphrodite que de pauvres travaileurs restaurent.

Après avoir volé la pierre de Chronos, Autolycus, le Roi des Voleurs, est accidentellement renvoyé avec Hercule cinq ans en arrière. Hercule retrouve Serena et va tout faire pour l'empêcher de tomber sous l'emprise d'Ares.

Iolaus fait toujours le même cauchemar : il imagine qu'il est attaqué par des hydres à trois têtes. C'est pourquoi, Hercule lui suggère de se reposer quelques temps. Alors que les deux amis organisent leurs vacances pour les bains de boue, la princesse Melissa d'Alcinie, elle-aussi, fait des cauchemars.

Hercule est prisonnier dans une mine avec Cassus, un homme accusé de meurtre, qui, après avoir été blessé par un éboulement, se vide peu à peu de son sang.

Hercule échoue dans la ville légendaire d'Atlantis et rencontre une femme nommée Cassandra, qui est mise à l'écart par les autres habitants depuis qu'elle a prédit que la ville allait être détruite.