Shinichi Kudô est un élève de première, féru d’énigmes, dont le sens de la déduction permet d’épauler la police dans bon nombre d’enquêtes. Lors d’une journée au parc d’attractions avec Ran Mouri, il surprend d’étranges hommes vêtus de noir qu’il devine être des maîtres chanteurs. Afin de le faire taire à jamais, il ingurgite un poison expérimental qui le fait rajeunir… Aidé par son voisin, le Dr Agasa, inventeur génial et farfelu, il décide de partir à la recherche de l’organisation secrète dont il a été victime. Cachant désormais sa véritable identité sous le pseudonyme de Conan Edogawa, un enfant de 7 ans, Shinichi se réfugie chez Ran, dont le père est détective. Le Sherlock Holmes moderne peut maintenant entrer en scène !
#241 L'affaire de la balle dans un train (2)
Date de diffusion : lundi 9 juillet 2001
25min
La bombe était un leurre. Un trafiquant de drogue est retrouvé assassiné dans les toilettes du train. Takagi a également du mal à être avec Sato car il veut sortir avec elle.
Un petit hôtel demande l'aide de Kogoro. Un homme a déposé une valise en laissant une somme d'argent conséquente. Mais le personnel de l'hôtel pense que cette valise est liée à la mort d'un individu retrouvé pendu dans les bois. Avant que la famille Mouri n'arrive à l'hôtel, un imposteur se faisant passer pour Kogoro prend la valise et l'emmène dans sa chambre. Le soir venu, il est retrouvé mort pendu par sa propre ceinture.
Invités, les Mouri dînent chez un architecte de renom, en compagnie de ses assistants et de son épouse. Aux alentours de 19:30, un coup de feu retentit. L'architecte est retrouvé dans son fauteuil, une balle dans la tête.
Les Détectives Junior s'amusent à la plage, en compagnie du professeur Agasa. Ils tombent par hasard sur Sonoko et Ran. Un pêcheur rencontré sur la plage plus tôt dans la journée, est retrouvé noyé, son corps enveloppé dans un filet de pêche.
Dans un endroit appelé la "forêt apaisante", il y a un petit village. Le chef de ce village est retrouvé mort, mais tout le monde dans le village a un alibi.
L'idole Yoko Okino invite Kogoro, Ran et Conan à une fête de fiançailles chez une amie à elle. Arrivé sur place, le détective apprend que l'amie en question vit sous la crainte d'un stalker. Plus tard dans la soirée, elle est retrouvée dans sa baignoire, égorgée mais consciente.
Il s'est avéré que l'amie de Yoko n'était pas encore morte - elle souffrait juste d'une grave coupure. La police est arrivée rapidement, mais ils n'ont pas pu trouver l'arme du crime. Tout ce qu'ils ont trouvé, c'est une traînée sanglante menant à l'arrière et un manteau ensanglanté. Ainsi, ils ont conclu que l'agresseur devait être le maître chanteur de l'ami de Yoko et qu'il ne faisait pas partie des personnes qui regardaient la bande vidéo. Mais Conan soupçonne que l'arme du crime a été jetée intelligemment.
Les Détectives Boys sont à la recherche d'un clown kidnappeur ! Ils doivent suivre les indices laissés pour sauver un garçon de 5 ans de son ravisseur.
Sato a une réunion de mariage arrangé avec un homme en raison de la persistance de sa mère. Elle arrive pour découvrir que c'est Ninzaburo Shiratori. Elle propose que si Takagi n'arrive pas chez elle avant le coucher du soleil, elle l'épousera qu'elle le veuille ou non. Il accepte, mais Takagi est occupé avec un vol de magasin. Trois des témoins oculaires donnent tous une description différente et trois coupables sont gardés à l'arrière de la voiture de police. Conan au téléphone se prépare à aider Takagi à résoudre l'affaire en tant que Kudo Shinichi.
Takagi résout l'affaire et arrête le coupable lorsqu'il tente de sortir de la voiture de police. Takagi se rattrape et renonce à retrouver Sato à temps pour arrêter le mariage car le soleil est presque couché et la voiture est trop loin. Son groupe vient l'encourager et il court. Conan parvient à arrêter le mariage à temps avec l'aide de Tomoaki Araide. Takagi parvient à rejoindre le restaurant mais le soleil s'est complètement couché. Il voit alors Sato au coin de la rue qui lui dit qu'un cas d'urgence s'était présenté. Takagi sourit en entrant dans la voiture. Pendant ce temps, Shiratori quitte le restaurant, déçu de son mariage proche. Conan commente comment Takagi et Sato lui ont rappelé Ran et lui-même.
#256 Le quatorzième concours de vers liés de Matsue Tamazo (2)
Date de diffusion : lundi 5 novembre 2001
25min
Après que Kogoro ait remporté un voyage à Matsue, ils rencontrent un groupe organisant un concours de poésie. Bientôt, l'un des membres est battu à mort et tous les autres membres ne sont pas tristes de le voir mort.
Un voleur est retrouvé mort dans un temple suite à un tremblement de terre. Cependant, le voleur vole dans un pauvre temple loin de chez lui. Quelque chose cloche dans cette affaire.
En sortant d'un cirque, les professeurs et les Detective Boys sauvent un étranger ressemblant fortement au riche propriétaire du cirque d'une foule de journalistes. L'homme dit s'appeler James Black, et être à la recherche d'un homme aux cheveux longs. Il veut remercier les enfants de leur aide, mais est de nouveau confondu pour son sosie fortuné et est enlevé par une bande de malfrats. Il a cependant eut le temps de laisser un indice pour Conan et les autres, et semble au courant des capacités de déduction du jeune détective. Un homme mystérieux rôde autour des évènements.
En raison de travaux de construction à proximité, un restaurant tremble constamment, provoquant des assiettes et des verres cassés. Lorsque le propriétaire est retrouvé mort le lendemain, cela ressemble à un accident, mais est-ce le cas ?
Kogoro, Ran et Conan se retrouvent bloqués sur une route enneigée en route vers une source chaude. Ils rencontrent la famille Daimon, qui les laisse passer la nuit, mais le lendemain matin, l'un d'eux est retrouvé mort.
#263 Le double mystère d'Osaka – Le sabreur et le Château Toyotomi
Date de diffusion : lundi 7 janvier 2002
1h 40min
Alors que Kogoro, Ran et Conan sont en route pour soutenir Heiji à un tournoi de Kendo à Osaka, un meurtre survient sur les lieux de la compétition. Le jeune détective est déterminé à résoudre l'enquête avant l'arrivée de son rival de l'Est. Après le tournoi, les Tokyoïtes visitent la ville. Pendant qu'ils sont au chateau d'Osaka, une affaire vieille de 13ans impliquant les pères de Heiji et Kazuha menace de se réveiller.
#264 Cour de confrontation : Eri Kisaki contre Kogoro Mouri (1)
Date de diffusion : lundi 14 janvier 2002
25min
Eri Kirisaki prend une affaire qui fait de Kogoro un témoin clé et un alibi pour le principal suspect. Eri gagnera-t-elle ou Kogoro fournira-t-il un alibi légitime ?
#265 Cour de confrontation : Eri Kisaki contre Kogoro Mouri (2)
Date de diffusion : lundi 21 janvier 2002
25min
Le procureur renverse la situation sur Eri lorsque le témoignage de Kogoro est bouleversé. Kogoro pourra-t-il trouver les preuves nécessaires à temps ?
#266 La vérité derrière la Saint Valentin (1 : L'affaire)
Date de diffusion : lundi 28 janvier 2002
25min
Pour la Saint Valentin qui approche, Sonoko emmène Ran à la montagne dans un atelier de confection de chocolats. Les deux détectives de l'agence Mouri sont aussi sur place, et, lors d'une tempête, un meurtre est découvert par Conan dans la forêt. Ran arrivera-t-elle à faire parvenir son cadeau à Shinichi à temps ?
#267 La vérité derrière la Saint Valentin (2 : Le raisonnement)
Date de diffusion : lundi 4 février 2002
25min
L'appareil photo du photographe mort contient des gouttelettes de sang, ce qui laisse penser à Conan que le meurtre a eu lieu avant la tempête de neige.
Un homme arrive à l'agence de détective Mouri pour une affaire. Quand il se rend compte que ce n'est que pour qu'on l'aide à retrouver une montre chez lui, Kogoro le renvoie, n'estimant pas l'affaire digne de lui. Les Detective Boys qui passaient par là se mettent sur l'affaire. Alors qu'ils sont chez le client, une personne est tuée dans la salle de télévision. Conan mène l'enquête !
Conan pense que le client les a embauchés pour être son alibi. Takagi révèle que des fichiers importants ont été volés au département de la police métropolitaine.